Fernando Morientes nació en la localidad cacereña de Cilleros. Con 4 años de edad, su familia se trasladó a Sonseca (Toledo) por motivos de trabajo de su padre.
Se inició en el Albacete, con 17 años de edad. Posteriormente, fue fichado por el Zaragoza en 1995, para después jugar en el Real Madrid, club donde permaneció desde 1997 hasta 2005, conquistando todos los títulos posibles en España, Europa, e incluso ganó la Copa Intercontinental.
Morientes ganó la Champions League 1999-2000, con gol suyo en la final disputada en París justamente ante el Valencia CF.
En 2003 llegó a jugar en la liga francesa, en condición de cedido, concretamente en las filas del AS Mónaco. Fue subcampeón europeo en 2004, perdiendo la final frente al FC Porto. Después de la buena campaña en Francia, Morientes volvió a Madrid, pero tampoco encontró su sitio.  Fichó en invierno de 2005 por el Liverpool, equipo en el que rinde de forma irregular.
En la temporada 2006-07, Morientes recala en el Valencia, donde destaca en partidos de liga y en competiciones internacionales.
Su debut con la selección se produjo el 25 de marzo de 1998 en Vigo (Galicia), partido en el que España ganó 4 - 0 a Suecia, marcando dos goles.
Ha participado en las fases finales del Mundial de Francia 1998, Mundial de Corea del Sur y Japón 2002, y en la Eurocopa 2004 de Portugal. Sorprendentemente no fue convocado para la fase final del Mundial de Alemania 2006, lo que causó una gran controversia. Morientes es el tercer máximo goleador de la historia de la Selección de fútbol de España con 27 dianas.